正和年間（１３１２～１６）に退居寮として開創。
　禅師は曹洞宗を修めた中国元の高僧で、１３０９年、時の執権北条貞時の招きで来日し、１３１０年円覚寺第１０世となり、暦応３年当寺にて遷化するまで、建長寺（１８世）、寿福寺などの住職を務めた。
　江戸時代前期には４０の塔頭があった。 現在は１８寺の塔頭があり、そのうち住職のおられるところは１３寺。 白雲庵はその中で最も古い塔頭である。