北条時宗は公安９年（１２８４）に死去したのだが、その菩提はこの円覚寺の仏日庵に葬られた。
　その後北条貞時の時代になり、円覚寺は朝廷から太政官符を与えられ、官寺の寺格を得ることになる。貞時の死に際しては法堂が完成し、法要が営まれた。建武・暦応年間（１３３３～１３４２）に描かれた「円覚寺境内絵図」には、総門から山門、仏殿などが中国の宋にならって一直線に並び、その隆盛を今に伝えている。