創建の時期は明確でない。伝承によると、 溝郷が天文（１５３２～５５年）年間に上溝と下溝の両村に分かれた際に、旧下溝村の鎮守として上溝村の亀ヶ池八幡宮から分霊を受けて建立されたとされている。
２０１２年４月４日午後０時５５分ごろ、相模原市南区下溝の下溝八幡宮から出火、木造平屋建ての本殿-約２００平方メートルが全焼し、隣接する小屋の一部約１０平方メートルが燃えた。けが-人はなかった。江戸時代に作られ、市の指定有形文化財に指定されている「木造不動明王-座像」は、別の社に保管されており無事だった。
この神社は、天文年間(１５３２ー１５５５年)に溝郷(ごう)が上溝と下津の両村に分かれた際に、下溝村の鎮守として上溝の亀ヶ池八幡宮から勧請(かんじょう)して創建された神社であると伝えられています。また、中世の屋敷跡と思われる「堀の内」と呼ばれる地点からみて、その裏鬼門(西南)にあたるので、ここに建立されたという話もあります。参道の脇にある小祠には、市の重要文化財に指定されている「不動明王坐像(ふどうみょうおうざぞう)が安置されています。これは享保９年(１７２４年)に後藤左近藤原義貴(ごとうさこふじわらよしたか)が製作したもので、もともとは別当(べっとう)大光院の本尊でした。
相模原市相模原市観光協会（案内板より）
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